Как зарегистрировать в муниципальной квартире?

Здравствуйте, понятия прописки не существует, если вы зарегистрированы в квартире, то имеете право в ней проживать. Тем не менее законодательство РФ не связывает однозначно факт регистрации с фактом проживания, таким образом, если вы являетесь членом семьи нанимателя - вашего отца, то действительно возможно проживание. В описанных обстоятельствах вы вместе не проживали, тем более он находится в местах заключения, поэтому говорить о том, что вы член семьи, учитывая, полагаю, ваш совершеннолетний возраст, нельзя. Соответственно пока не зарегистрируетесь, вы не сможете в квартире проживать. Зарегистрировать вас может ваш отец, соответствующее заявление он может направить в регистрирующий орган, либо оформить доверенность по месту нахождения, соответственно представитель ( вы им быть по данному вопросу не можете) может подать за него соответствующее заявление. Естественно, ваш отец может участвовать в приватизации, а, если вы зарегистрируетесь в квартире, то квартира может быть передана в собственность и вам, и вашему отцу в собственность в порядке приватизации. Вы можете после того, как в квартире зарегиструретесь, собрать все документы, от отца потребуется согласие на участие в приватизации, без этого квартиру не приватизировать. Либо представитель по доверенности может оформить документы для передачи квартиры в собственности отцу, если только он будет в ней зарегистрирован. После заключения договора с собственником о безвозмездной передачи жилья в собственность в порядке приватизации можно будет обратиться в Росреестр, МФЦ для регистрации изменений и внесения записи в Единый государствненый реестр недвижимости.